En Time Paradox Ghostwriter, Teppei Sasaki, un joven artista de manga, ha dedicado años de su vida para alcanzar su sueño de ser serializado en Weekly Shounen Jump, solo para enfrentarse a rechazos constantes. Desesperado tras el último rechazo de su one-shot, Teppei decide abandonar su sueño después de cuatro largos años de esfuerzo sin recompensa. Sin embargo, un extraño suceso cambia su destino cuando un rayo cae sobre su apartamento, fusionando su microondas y su nevera. De manera inexplicable, el electrodoméstico combinado escupe una revista: un número de Shounen Jump de 10 años en el futuro.

En la portada de esta revista futurista se encuentra «White Knight», una obra maestra creada por Itsuki Aino, una joven autora debutante. La perfección de la historia conmueve profundamente a Teppei, quien cree que la idea proviene de su propia imaginación cuando la revista desaparece. Convencido de que ha tenido una revelación creativa, Teppei copia la historia y la presenta como su propio trabajo. Para su sorpresa, los editores de Shounen Jump quedan impresionados con la obra, considerando que es lo suficientemente buena para ser serializada como una serie regular.

Finalmente, Teppei logra cumplir su sueño y White Knight se publica, pero en algún lugar, una joven de 17 años llamada Itsuki Aino abre el último número de Shounen Jump solo para descubrir que su historia, que aún no ha escrito, ya ha sido publicada bajo el nombre de Teppei. A medida que la verdad comienza a desmoronarse, Teppei se verá atrapado en una encrucijada entre el éxito y las implicaciones éticas de su misteriosa «inspiración» del futuro.

Time Paradox Ghostwriter explora el peso de los sueños, la creatividad y las decisiones morales en un mundo donde el tiempo y el destino parecen estar fuera de control.