En Baki-Dou, la historia se centra en Baki Hanma, quien ha alcanzado el reconocimiento como el «Chico más fuerte del mundo». Sin embargo, a pesar de su impresionante título, se siente atrapado en una rutina monótona, sin desafíos que lo motiven. Después de haber superado la amarga rivalidad con su padre, Yuujirou, Baki se encuentra en la Arena Subterránea de Kourakuen, donde sus victorias son casi triviales, lo que alimenta su desinterés por la lucha.

La paz y la tranquilidad que Baki anhela son pronto interrumpidas por un acontecimiento extraordinario: un experimento clandestino ha logrado clonar a Musashi Miyamoto, el legendario samurái japonés. Esta resurrección trae consigo un nuevo conflicto, ya que Miyamoto, atrapado entre su glorioso pasado y la modernidad, busca reafirmar su poder en un mundo que no comprende del todo. Con su inquebrantable espíritu de lucha y su fuerte sentido del honor, se convierte en un desafío formidable para Baki y sus amigos, quienes luchan por mantener su relevancia en un entorno que les resulta ajeno.

A medida que Baki se prepara para enfrentar a este nuevo rival, se despierta en él una chispa de emoción que creía perdida. La historia de Baki-Dou se despliega como una intensa exploración de la lucha, la identidad y el significado del verdadero poder, llevando a los personajes a confrontar sus pasados y redefinir lo que significa ser un guerrero en un mundo en constante cambio. Con peleas épicas y un enfoque en el desarrollo de los personajes, este manga es un festín para los amantes de la acción y el arte marcial.