Ash Lynx es una belleza, un genio y un asesino. Desde su infancia, ha estado al cuidado de Dino «Papá» Golzine, el jefe de la mafia que lo convirtió en el despiadado asesino que es ahora. Al principio, Ash no era más que una cara bonita para el placer de Golzine, pero ahora, alejado de él, un Ash de 17 años dirige su propia banda con puño de hierro. Eiji Okumura es un joven fotógrafo japonés. Eiji viaja a Nueva York como ayudante para realizar un reportaje sobre los niños que viven en la calle. Allí conoce al líder de una banda adolescente, Ash, y queda fascinado por el chico, que a su vez siente curiosidad por el estilo de vida diferente de Eiji. Pero esto es el oscuro subsuelo de Nueva York, y recientemente ha surgido una serie de asesinatos en la ciudad, conectados sólo por las palabras «Banana Fish». Con intereses personales en juego en esta misteriosa batalla, depende de Ash, Eiji y sus aliados descubrir qué es exactamente el «Banana Fish», de dónde viene y cómo deshacerse de él, antes de que el mundo tal y como lo conocen caiga en el caos.