En Jagaaaaaan, Shintarou Jagasaki es un oficial de policía de barrio que lleva una vida común y corriente, pero insatisfecha. Aunque en el exterior parece un hombre alegre y está en una relación estable con planes de casarse, su realidad interna es mucho más oscura. Shintarou odia su monótona vida diaria y sueña con romper la rutina de formas violentas. Fantasea con disparar a los molestos transeúntes con una pistola, inspirado por el héroe local, la mascota de la ciudad, una figura de apariencia ridícula pero peligrosa.

Todo cambia cuando Shintarou presencia un violento asesinato a manos de un hombre convertido en monstruo. Al ver a su compañero morir brutalmente, se da cuenta de lo vacía que ha sido su existencia. Justo cuando cree que ha llegado su final, un poder misterioso emerge de su cuerpo: dispara un proyectil mortal desde su dedo, matando a la criatura. Descubre que su brazo ha sido transformado por una sustancia extraña, que ahora lo vincula a un poder desconocido.

Un búho, que ha estado observando todo, le revela que el monstruo que lo atacó fue una vez humano, transformado por un «Mad Xenopus», un parásito similar a una rana que controla a su huésped y lo convierte en una bestia. Al principio, Shintarou se niega a involucrarse en esta nueva realidad, pero cuando uno de estos parásitos toma el control de su futura esposa, se ve obligado a enfrentar su destino. Ahora, armado con habilidades letales y enfrentando la amenaza de los humanos transformados, Shintarou se embarca en una violenta cruzada para eliminar a estos monstruos antes de que destruyan todo lo que ama.

Jagaaaaaan es una historia oscura y retorcida que explora los límites del poder y la humanidad en medio de una batalla desesperada por la supervivencia.