La historia continúa donde la primera temporada terminó solo unos meses en el futuro. Yuokai Gakuen ha sido reparado y el nuevo semestre está en marcha. Tsukune y su pandilla han vuelto, y son más poderosos que nunca. Se alivia la verdadera identidad de Anti-Thesis. Con nuevos adversarios asomando en el horizonte, y algo mucho más siniestro de lo que la pandilla ha enfrentado antes. Tsukune está luchando con el monstruo dentro de él. Con la ayuda de Moka, Mizore, Kurumu, Ruby y Yukari. Tsukune entrena para controlar su sangre de vampiro y la fuerza para proteger lo que ama. La nueva temporada se centra más en las niñas, su pasado y sus familias. Les esperan nuevos enfrentamientos. Nuevos amigos y aliados se unirán a ellos a su lado. Juntos descubrirán los secretos del rosario de Moka y su linaje …