«Owari no Seraph» narra la desgarradora historia de Yuuichirou Hyakuya, un joven que, tras perder a sus padres, es llevado al orfanato Hyakuya. A pesar de sus intentos de encontrar un nuevo hogar y familia, su vida da un giro dramático cuando un virus devastador acaba con todos los adultos mayores de 13 años. Este evento catastrófico permite que vampiros, que permanecían ocultos bajo tierra, emergen para someter a los sobrevivientes humanos, convirtiéndolos en ganado para la extracción de sangre.

Cuatro años después, Yuuichirou y sus amigos huérfanos han aprendido a vivir bajo el dominio vampírico, aunque la sed de venganza de Yuuichirou hacia estas criaturas sigue latente. Su deseo de exterminar a los vampiros a menudo choca con las estrategias más cautelosas de Mikaela Hyakuya, su compañero de orfanato, quien sugiere utilizar astucia para sobrevivir. A medida que Mikaela logra ganarse la confianza de los vampiros de alto rango, descubre planes que podrían llevar a su grupo a una arriesgada fuga. Sin embargo, sus esfuerzos se ven interrumpidos por el oficial vampírico Ferid Bathory, quien ataca a los orfanatos y deja a Yuuichirou como el único sobreviviente.

Escapando al mundo exterior, Yuuichirou es encontrado por la Compañía Demonio Luna, un escuadrón militar dedicado a la caza de vampiros. Al unirse a esta unidad, Yuuichirou finalmente ve la oportunidad de cumplir su objetivo: vengar la muerte de su familia y erradicar a los vampiros que han sumido al mundo en el caos. «Owari no Seraph» es una serie que combina acción, drama y el intenso deseo de justicia, mientras explora la lucha de la humanidad por recuperar su libertad en un mundo dominado por seres oscuros.